Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms