Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCZQ96LD1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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