Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms