Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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MVB12AQ96EY5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MVB12AQ96EY5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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