Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHFRQ96EP1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms