Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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GTF3C6Q969F1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GTF3C6Q969F1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GTF3C6Q969F1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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