Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A1Q93096 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms