Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG4Q92954 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms