Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC12Q8WUD4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms