Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms