Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FNDC9Q8TBE3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms