Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP43Q8NFH3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms