Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIK3C3Q8NEB9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms