Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC103Q8IW40 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms