Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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