Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms