Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms