Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms