Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL17Q6TDP4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL17Q6TDP4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms