Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
KRTAP21-2Q3LI59 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms