Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CTF1Q16619 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CTF1Q16619 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CTF1Q16619 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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CTF1Q16619 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CTF1Q16619 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CTF1Q16619 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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