Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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