Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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GRIK5Q16478 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK5Q16478 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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