Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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