Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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