Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDGFRLQ15198 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDGFRLQ15198 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms