Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRS1Q15050 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms