Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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