Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPIDRQ14159 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPIDRQ14159 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms