Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM29Q14134 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms