Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL4BQ13620 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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