Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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CUL3Q13618 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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CUL3Q13618 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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