Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR3Q13615 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR3Q13615 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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