Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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