Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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