Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFFO1Q0D2I5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms