Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF4Q08170 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms