Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTBN1Q01082 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTBN1Q01082 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms