Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK6Q00534 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms