Protein–RNA interactions for Protein: Q00325

SLC25A3, Phosphate carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3Q00325 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC25A3Q00325 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A3Q00325 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms