Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRX6P78412 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX6P78412 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX6P78412 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX6P78412 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRX6P78412 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRX6P78412 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms