Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITX1P78337 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITX1P78337 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms