Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPS4XP62701 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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