Protein–RNA interactions for Protein: P55957

BID, BH3-interacting domain death agonist, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIDP55957 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BIDP55957 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BIDP55957 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BIDP55957 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIDP55957 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIDP55957 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIDP55957 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIDP55957 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIDP55957 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIDP55957 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIDP55957 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BIDP55957 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms