Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX2P52951 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX2P52951 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX2P52951 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX2P52951 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX2P52951 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX2P52951 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX2P52951 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GBX2P52951 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GBX2P52951 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms