Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB28P51157 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB28P51157 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms