Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLK1P49759 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLK1P49759 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLK1P49759 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms