Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGM4P49221 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms