Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GNPDA1P46926 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GNPDA1P46926 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms