Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN7P35236 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms